Содержание
Пилотная фаза проекта – 2003-2007 г.
исследование и сравнение существующих методов анализа последовательности генома
исследование набора участков ( ~ 1% генома)
Продуктивная фаза – сентябрь 2007 — …
использование полученных данных для анализа всего генома
Выдержка из текста
Проект – «ENCODE» (от «Encyclopedia of DNA Elements») – международный проект, организованный и финансируемый американским Национальным институтом исследований генома человека. Проект стартовал сразу после окончания проекта «Геном человека», в 2003 году.
По завершению проекта «Геном человека» весь геном был отсеквенирован и аннотирован. Выяснилось, что он содержит примерно 20 000 белок-кодирующих генов, что было гораздо меньше ожидаемого количества, предварительно называли цифру в 300000 генов
Список использованной литературы
1. Мушкамбаров Н.Н. (2014). «Неизвестная» ДНК эукариот, или Что делает человека человеком, «Пространство и время», №3(17)/2014
2. The Encode Project Consortium (2007). Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project. Nature, 14.06.2007
3. Adli M, Bernstein B.E. (October 2011). Whole-genome chromatin profiling from limited numbers of cells using nano-ChIP-seq. Nature Protocol 6 (10): 1656–68.
4. Ansorge WJ. (2009). Next-generation DNA sequencing techniques. New Biotechnology. Apr 25, 2009
5. George M. Weinstock (2007). ENCODE: More genomic empowerment. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2007
6. Thomas R. Gingeras (2007). Origin of phenotypes: Genes and transcripts, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2007
7. Manolis Kellisa, Barbara Woldc, Michael P. Snyderd, Bradley E. Bernsteinb, Anshul Kundajea, Georgi K. Marinovc, Lucas D. Warda, Ewan Birneyg , Gregory E. Crawfordh, Job Dekkeri, Ian Dunhamg, Laura L. Elnitskij , Peggy J. Farnhamk, Elise A. Feingoldj, Mark Gersteinl, Morgan C. Giddingsm, David M. Gilbertn, Thomas R. Gingeraso, Eric D. Greenj, Roderic Guigop, Tim Hubbardq, Jim Kentr, Jason D. Liebs, Richard M. Myerst, Michael J. Pazinj, Bing Renu, John A. Stamatoyannopoulosv , Zhiping Wengi, Kevin P. Whitew, and Ross C. Hardisonx (2014). Defining functional DNA elements in the human genome. PNAS April 29, 2014 vol. 111/no. 17
8. Mark B. Gerstein, Joel S. Rozowsky, Deyou Zheng, Jiang Du, Jan O. Korbel, Olof Emanuelsson, Zhengdong D. Zhang, Sherman Weissman, and Michael Snyder (2015). What is a gene, post-ENCODE? History and updated definition. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2015