Содержание
нет
Выдержка из текста
Псевдогены представляют собой гомологичные последовательности, происходящие от эволюционно активных генов, которые потеряли свои способности функционировать в результате нарушенной транскрипции или трансляции. Они могут содержать стоп-кодоны, повторяющиеся элементы, сдвиг рамки считывания и/или отсутствие транскрипции. Однако, они могут сохранять подобные гену функции, содержать промоторы, CpG островки и сайты сплайсинга. Псевдогены представляют особый интерес для биологов, так как они могут препятствовать проведению молекулярно-генетических исследований (например, предсказанию функций генов и проведению ПЦР-амплификации, необходимой для их анализа).
В целом, различают две категории псевдогенов: 1) преобразованные псевдогены, возникшие вследствие ретротранспозонных событий, которые обусловлены встраиванием в геном продукта обратной транскрипции мРНК; такие процессированные псевдогены редко содержат промоторы или интроны, некоторые из них могут сохранять часть поли-А хвоста, который не может быть полностью деградирован; 2) непреобразованные или дублированные псевдогены являются результатом дупликации геномной ДНК или неравного кроссинговера и сохраняют основную структуру функциональных генов, например, промоторы и интроны. Третий класс псевдогенов — унитарные псевдогены, образуются в результате нарушений в пределах ранее функциональных генных регионов (делеции, инсерции, вставки).
Идентификация псевдогенов в геномах имеет важное значение для точного выявления и аннотирования функциональных генов, для эволюционного анализа геномов и структурных генов, а также для определения собственно функции псевдогенов. Псевдогены обычно встречаются в геномах разных таксонов и видов, наиболее подробно они описаны у кишечной палочки, дрожжей, риса, арабидопсиса, нематоды, дрозофилы, мышей и человека. Установлено, что геном человека кодирует от 22000 до 75000 генов, около 22% из которых являются псевдогенами.
Список использованной литературы
Список использованной литературы:
1) Tutar Y. Pseudogenes//Functional Genomics.- 2012.-V.12.- P. 4-8.
2) Pink R. C., Wicks K., Caley D. P., Punch E. K., Jacobs L., Carter D. R.F. Pseudogenes: pseudo-functional or key regulators in health and disease //RNA.-2011.- vol. 17.-№ 5.- P. 792–798.
3) Chang Mian J.I., You H.A., Ling L.W., Hua P.G., Ce W.G.. Identification and bioinformatics analysis of pseudogenes from whole genome sequence of Phaeodactylum tricornutum//Chin. Sci. Bull.- 2013.- V. 58.- P. 1010-1018.
4) Fuxelius H.H., Darby A.C., Cho N.H., Andersson G.E. Visualization of pseudogenes in intracellular bacteria reveals the different tracks to gene destruction// Genome Biology.- 2008.- V. 9.- P. 42-57.
5) Lawrence J.G., Hendrix R.W., Casjens S. Where are the pseudogenes in bacterial genomes? //Trends Microbiol.- 2001.- V. 9.- P. 535-540.